投加碳源目的是為了脫氮，但考慮脫氮效果的同時，也要兼顧污水處理廠的運行穩(wěn)定，避免處理費用增加。

1、污泥產(chǎn)量

首先，投加碳源必會增加污泥的產(chǎn)量，而污泥處理成本很高。
常用的碳源中乙酸、乙酸鈉價格較貴，產(chǎn)泥率高，對污水廠的污泥處置會帶來了一定的壓力。
以葡萄糖為代表的糖類物質(zhì)作為外加碳源使得脫氮效果良好，可是，糖類作為多分子化合物，容易引起細菌的大量繁殖，導(dǎo)致污泥膨脹。

2、出水COD值、亞硝基氮累積

其次，部分碳源的投加也會影響出水COD值和亞硝基氮累積。
以糖類作為碳源，會增加出水中COD的值，影響出水水質(zhì)。同時，與醇類碳源相比，更容易產(chǎn)生亞硝態(tài)氮積累的現(xiàn)象。
甲醇作為外碳源雖然具有運行費用低、污泥產(chǎn)量小的優(yōu)勢，但在甲醇碳源不足時，存在亞硝酸鹽積累的現(xiàn)象。
并且如果投加量控制不好，或者系統(tǒng)來水變化波動太大，容易造成生化系統(tǒng)中毒，好氧區(qū)域絲狀菌膨脹。